Свободно распространяемые программы для Windows

Анализ многоканальных изображений микроскопа

Свободный программный пакет для анализа, обработки и визуализации многомерных изображений с микроскопа.

Основные особенности

BioImageXD является многоцелевым инструментом пост-обработки для биоимиджинга. Программное обеспечение может использоваться для простой визуализации многоканальных временных стеков изображения к сложному 3D предоставлению многократных каналов одновременно. Анимация из 3D визуализации может быть легко создана при помощи виртуальной камеры летающего пути или ключевых кадров.

Общая информация

  • Свободный и общедоступный
  • Все функциональные возможности обеспечивают поддержку 3D временного ряда данных (4D)
  • Пакетная обработка данных без программирования
  • На экране описание особенностей и цветное кодирование помогают в использовании
  • VTK и ITK
  • Создание видео любой сцены, представленной в 3D режиме

Поддержка типов файла

  • Carl Zeiss LSM
  • Olympus OIF
  • Leica TXT & LIF
  • BioRad PIC
  • MRC
  • Interfile
  • TIFF, PNG, JPEG, BMP (чтение и запись)
  • OME-TIFF (чтение и запись)
  • VTK XML (запись)    
  • Внутренние форматы BioImageXD (чтение и запись)

Способы просмотра изображения

  • Части
  • Галерея
  • Ортогональные секции
  • Максимальная и средняя проекция интенсивности
  • 3D-рендеринг (интерактивное и полное качество, несколько модулей могут отображаться одновременно)

Количественный анализ

  • Анализ колокализации (воксел и объект)
  • 3D методы сегментации
  • Разделение объекта
  • Анализ объекта
  • Отслеживание движения
  • Анализ интернализации
  • Анализ региона интереса (ROI)
  • Флуоресценции восстановления после фотообесцвечивающего анализа (FRAP)

Обработка изображения

  • Регулировка цвета, яркость, контраста и гаммы
  • Слияние каналов передачи данных в цветные
  • Фильтрация шума
  • Морфологические, логические и арифметические операции
  • Преобразования Фурье
  • Методы выявления признаков
  • Регистрационные методы
  • Деконволюция
  • Исправление отбеливателя флюоресценции

Другое

  • Изменение размеров изображения и передискретизация
  • Имитация формирования данных для валидации метода
  • И многое другое...

Язык: Английский
Лицензия:
GNU GPL v2

Протестировано на ОС: Windows 7 x64, Windows 10 x64

Официальный сайт: www.bioimagexd.net

Перейти в каталог загрузки на официальном сайте

Скачать

Внимание, резервная копия обновляется очень редко, так как нужна на случай удаления дистрибутива с официального сайта.

Резервная копия на Яндекс Диске, версия 1 .0-r1799

Добавить комментарий